O ano foi de um novo recomeço. A reformulação da comissão técnica e do elenco aconteceu para que o time não repetisse o ano anterior. Além do novo treinador, novos jogadores também começaram a aparecer. A diretoria também começou a ganhar reforços, como o de Antônio Carletto. No começo do Paranaense, enquanto o Atlético tentava o tetra-campeonato, os outros times corriam por fora tentando derrubá-lo mas, não foi preciso muito. Sem o planejamento que o fez campeão brasileiro em 2001, o Atlético estava se acostumando a campanhas ruins.

Mas dentre todas as notícias durante o Paranaense, uma delas era boa. Após a terceira rodada, o clube anunciou a contratação do goleiro Diego, revelação do ano anterior pelo Juventude, de Caxias do Sul, que fez sua estréia na derrota em casa para o Grêmio Maringá, o que lhe rendeu diversas provocações adversárias. Mas o goleiro não deixou-se abater. Mais um reforço estava vindo. Para suprir a falta dos atacantes Alex e Kleber, veio da Hungria o jogador Tüske, que não chegou a jogar no time principal atleticano. Com uma campanha ruim, a troca de técnicos foi novamente inevitável. Antes da partida contra a Portuguesa, Vadão já estava treinando o time. Junto com o técnico, o também velho conhecido dos torcedores, Leomar desembarcou no Ct. Após uma primeira fase não muito boa, o Atlético acabou desclassificado nas quartas-de-final, pelo Londrina.

Após o estadual, a diretoria foi em busca de reforços no interior de São Paulo para reforçar o time na Copa do Brasil. Passando fácil pelo Tuna Luso na primeira fase, não conseguiu repetir o feito em cima do Sport e foi desclassificado. Agora só restava esperar pelo Brasileiro, o primeiro por pontos corridos. Com um campeonato mais longo, os reforços começaram a aparecer. O atacante Ricardinho, chamado no interior de São Paulo de ‘Rei do Drible', Capone, o zagueiro Tiago, o volante Izaías e o atacante Lê chegaram para integrar o elenco. E o começo de campeonato foi bom, uma vitória em cima do Grêmio fez os torcedores acreditarem que algo estava mudando. Na segunda rodada o rubro-negro foi derrotado pelo rival Paraná Clube, no clássico da paz.

E o Atlético, que dificilmente perdia algum jogo na Arena, começou a decepcionar. Fora de casa venceu sua primeira partida apenas na vigésima sexta rodada, em cima do Atlético Mineiro. Em maio, o Atlético resolveu apostar em um jogador que há muito estava parado. Washington havia feito uma cirurgia no coração e, os médicos ficaram com medo de deixá-lo jogar. O atacante assinou contrato com o rubro-negro somente depois de realizar todos os exames necessários e, ainda assim, não chegou a atuar na temporada de 2003. Com a chegada do Estatuto do Torcedor, os clubes brasileiros ameaçaram não entrar em campo na rodada seguinte, por não aceitarem certas cláusulas como a que responsabiliza o clube por qualquer atitude violenta de torcedores ao redor do estádio. Não teve jeito e os times entraram em campo.

Em maio, a convocação para a Seleção Brasileira desmanchou o rubro-negro. Ilan, Adriano e Kleberson foram chamados pelo técnico Parreira. E, enquanto folgava na rodada do Brasileiro, o Atlético recebia em casa a Seleção Sub-20 e venceu por 3x1. Do lado canarinho, estavam os atleticanos Jean e Fernandinho. Para reforçar o elenco e após uma briga com o Flamengo, Nélio também desembarcou no CT mas, machucado, pouco disputou pelo rubro-negro. Para surpresa dos torcedores, que ainda queriam ver um bom lateral-esquerdo, Jean foi vendido para um time holandês. E, finalmente, Kleberson foi vendido para o Manchester United, da Inglaterra. Tentando uma reação no campeonato, Alex Mineiro é chamado novamente para integrar o elenco. Para completar, Dagoberto volta como campeão do Pan-Americano e propostas começam a aparecer para o jogador.